據相關規定自97年10月10日起，開放旅客攜帶寵物【限貓、狗、兔、魚蝦類】搭乘全線各級列車，為了避免影響其他乘車旅客權益，另規定旅客攜帶寵物隨乘應行註意事項，
規定寵物必須裝入寵物箱【限長43公分、寬32公分、高31公分以下】內，且需包裝完固無糞便漏出，並放置於座位下方空間自行保管，責任自負，需避免寵物叫聲影響車廂安寧，並需讓出進出的路線；而且行程中不得取出把玩或放置在座椅上，每人限攜帶1件。如超過限制尺寸，請利用託運方式運送。
【註：禽、鳥類動物禁止旅客以任何方式攜帶上車。】
【註：毒蛇猛獸等有可能會危害到旅客的，禁止旅客以任何方式攜帶上車。】
【註：執行任務的警犬、導盲犬不在此限。】
