包括信用卡線上付款、便利商店現金付款取票(設有ibon設備的統一超商、設有FamiPort設備的全家便利商店、設有Life-ET設備的萊爾富便利商店及設有OK?go的OK超商)，或至本公司各車站的售票窗口及自動售票機以現金、信用卡或金融卡付款取票。
使用統一超商ibon、全家便利商店FamiPort及萊爾富便利商店Life-ET購票或取票者，每張乘車票將收取手續費10元新台幣(去回票以2張計算)；使用OK超商OK?go購票或取票者，每張乘車票將收取手續費8元新台幣(去回票以2張計算)。
另外，台灣島旅遊網推出了台灣高鐵車票代訂服務，大陸客人可以用支付寶付款，網址是http://gaotie.taiwandao.tw
